農(nóng)業(yè)農(nóng)村局專門檔案必須集中統(tǒng)一在本單位綜合檔案室管理各種門類的檔案管理所遵循的依據(jù)是國(guó)家關(guān)于檔案工作的方針、政策、法律、法規(guī)，檔案行政管理部門制定的規(guī)章、制度、規(guī)范、標(biāo)準(zhǔn)。如《中華人民共和國(guó)檔案法》《檔案法實(shí)施辦法》《機(jī)關(guān)檔案工作條例》等。我國(guó)檔案工作的基本原則是實(shí)行檔案的集中統(tǒng)一管理。專門檔案是國(guó)家全部檔案的一個(gè)組成部分，也是現(xiàn)行機(jī)關(guān)、團(tuán)體、企業(yè)、事業(yè)單位檔案的組成部分，必須實(shí)行統(tǒng)一管理。專門檔案無論是會(huì)計(jì)檔案、審計(jì)檔案還是土地管理檔案都具有整體性和成套性的特點(diǎn)。

從宏觀上講，各種門類的檔案，必須依據(jù)檔案工作共同的管理法規(guī)、標(biāo)準(zhǔn)、規(guī)范，針對(duì)不同門類檔案的特殊性，把各種門類檔案集中統(tǒng)一管理。雖然專門檔案具有整體性、成套性的特點(diǎn)，但管理的具體方法各異。專門檔案應(yīng)該實(shí)行集中統(tǒng)一管理，這是由國(guó)家性質(zhì)和社會(huì)制度決定的，應(yīng)該歸國(guó)家和人民所有。專門檔案辦理完畢必須收歸本單位的綜合檔案室。一個(gè)單位的全部檔案是一個(gè)不可分割的整體，各種專門檔案屬于這個(gè)整體的成分之一。對(duì)于需要長(zhǎng)遠(yuǎn)保管的檔案，在本單位保存一定年限后，應(yīng)統(tǒng)一移交給當(dāng)?shù)赜嘘P(guān)檔案館，不得任意轉(zhuǎn)移、銷毀。從微觀上講，各種專門檔案在本單位應(yīng)該有統(tǒng)一的科學(xué)管理方法，其中最主要的是專門檔案形成前的文件材料的積累和歸檔，要納入檔案綜合管理程序和工作計(jì)劃中，全體工作人員需要具備一定的檔案意識(shí)，養(yǎng)成良好的工作習(xí)慣，做到處理問題有依據(jù)，處理過程有記錄、有統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)，處理結(jié)果有總結(jié)。

維護(hù)專門檔案的完整與安全維護(hù)專門檔案的完整與安全，對(duì)專門檔案管理具有十分重要的意義。完整，是從數(shù)量的意義上講的，就是要使專門檔案收集齊全，不能殘缺不全。從質(zhì)量上 401 來講，就是要保證專門檔案的準(zhǔn)確、系統(tǒng)，不能與客觀實(shí)際相抵觸，更不能任意割裂分散。安全是一定要保證專門檔案的真實(shí)、可靠。改善專門檔案的保管條件，實(shí)行科學(xué)管理，方可延長(zhǎng)專門檔案的使用壽命，避免不應(yīng)有的損失。專門檔案，特別是合同檔案、訴訟檔案等，若不完整、不準(zhǔn)確、不系統(tǒng)，不僅影響使用，甚至有害，造成假象，引出錯(cuò)誤結(jié)論，造成與事實(shí)不符的冤假錯(cuò)案，給個(gè)人、集體、國(guó)家造成不應(yīng)有的損失。